Broadの日本におけるゲノム編集特許の状況
気がつくとあっという間に数ヶ月がたつものです。
備忘録がてらに１投稿。
Broadの下記２件の出願について、本年１月２９日付けで拒絶審決の取消を求めた審決取消訴訟が知財高裁に提起されました。
いずれも、JP出願においては比較的広いクレームです。EPではもっと広いクレームがありますが。
特願2016-117740（平31行ケ10010）
【請求項１】
エンジニアリングされた、天然に存在しないクラスター化等間隔短鎖回分リピート（ＣＲＩＳＰＲ）－ＣＲＩＳＰＲ関連（Ｃａｓ）（ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ）ベクター系であって、
ａ）ガイド配列、ｔｒａｃｒＲＮＡ及びｔｒａｃｒメイト配列を含むＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ系ポリ－ヌクレオチド配列をコードするヌクレオチド配列に作動可能に結合している第１の調節エレメントであって、前記ガイド配列が、真核細胞中のポリヌクレオチド遺伝子座中の１つ以上の標的配列にハイブリダイズする、第１の調節エレメント、
ｂ）ＩＩ型Ｃａｓ９タンパク質をコードするヌクレオチド配列に作動可能に結合している第２の調節エレメント、
ｃ）組換えテンプレート
を含む１つ以上のベクターを含み、
成分（ａ）、（ｂ）及び（ｃ）が、前記系の同じ又は異なるベクター上に位置し、前記系が、前記Ｃａｓ９タンパク質をコードする前記ヌクレオチド配列とともに発現される１つ以上の核局在化シグナル（複数の場合も有り）（ＮＬＳ（複数の場合も有り））をさらに含み、
それによって、前記ガイド配列が、真核細胞中の前記１つ以上のポリヌクレオチド遺伝子座を標的とし、前記Ｃａｓ９タンパク質が、前記１つ以上のポリヌクレオチド遺伝子座を開裂し、それによって、前記１つ以上のポリヌクレオチド遺伝子座の配列が、改変される、
ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓベクター系。
特願2016-128599（平31行ケ10011）
【請求項１】
エンジニアリングされた、天然に存在しないクラスター化等間隔短鎖回分リピート（ＣＲＩＳＰＲ）－ＣＲＩＳＰＲ関連（Ｃａｓ）（ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ）ベクター系であって、
ａ）真核細胞中のポリヌクレオチド遺伝子座中の標的配列にハイブリダイズする１つ以上のＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ系ガイドＲＮＡをコードする１つ以上のヌクレオチド配列に作動可能に結合している第１の調節エレメントであって、前記ガイドＲＮＡが、ガイド配列、ｔｒａｃｒ配列及びｔｒａｃｒメイト配列を含む、第１の調節エレメント、
ｂ）ＩＩ型Ｃａｓ９タンパク質をコードするヌクレオチド配列に作動可能に結合している第２の調節エレメントであって、前記タンパク質が、核局在化シグナル（ＮＬＳ）を含む、第２の調節エレメント
を含む１つ以上のベクターを含み；
成分（ａ）及び（ｂ）が、前記系の同じ又は異なるベクター上に位置し、
前記ｔｒａｃｒ配列が、３０以上のヌクレオチドの長さを有し、
それによって、前記１つ以上のガイドＲＮＡが、真核細胞中の前記ポリヌクレオチド遺伝子座を標的とし、前記Ｃａｓ９タンパク質が、前記ポリヌクレオチド遺伝子座を開裂し、それによって、前記ポリヌクレオチド遺伝子座の配列が、改変され；
前記Ｃａｓ９タンパク質及び前記１つ以上のガイドＲＮＡが、いっしょに天然に存在しない、
ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓベクター系。
いずれの案件も拡大先願および進歩性欠如に基づき、拒絶審決されています。
知財高裁への出訴時に代理人を、医薬系では超有名な某事務所に変更したという風の噂を耳にしたので、米国の応答方針をそのまま日本に適用するという、米国代理人がやりがちな筋悪な対応からは方針が変わっているでしょう。
最近の知財高裁の判決の傾向からすると、進歩性より拡大先願が問題になりそう。
髙部所長がどういう判断をされるかが楽しみです。
UCB v Broadのインターフェアレンス 第2段開始のお知らせ
CRISPR-Cas9の米国における基本特許について下記の投稿してから5ヶ月立ちました。
が、6月24日のinterferenceが宣言され、再戦です。
UCBの特許を追っかけていた人はクレームをガチンコで寄せていたので、うすうす気付いていたでしょうし、4月頃にリークされていましたね。
今回のinterferenceの対象の出願／特許は下記の通りです。
https://www.broadinstitute.org/files/news/pdfs/106115-NoticeDeclaringInterference.pdf
UCB出願（10出願）
US 15/947,680; US 15/947,700; US 15/947,718; US 15/981,807; US 15/981,808; US 15/981,809; US 16/136,159; US 16/136,165; US 16/136,168; and US 16/136,175.
Broad出願／特許（13特許、1出願）
8,697,359; 8,771,945; 8,795,965; 8,865,406; 8,871,445; 8,889,356; 8,895,308; 8,906,616; 8,932,814; 8,945,839; 8,993,233; 8,999,641; 9,840,713;
14/704,551
今回のinterferenceでは、下記がカウントとして設定されています。
UCB application（15/981,807）
Claim 156:
A eukaryotic cell comprising
a target DNA molecule and an engineeredand/or non-naturally occurring Type II Clustered Regularly Interspaced Short PalindromicRepeats (CRISPR)-—CRISPR associated (Cas) (CRISPR-Cas) system comprising
- a) a Cas9 protein, or a nucleic acid comprising a nucleotide sequence encoding said Cas9protein; and
- b) a single molecule DNA-targeting RNA, or a nucleic acid comprising a nucleotidesequence encoding said single molecule DNA-targeting RNA; wherein the single molecule DNA-targeting RNA comprises:
- i) a targeter-RNA that is capable of hybridizing with a target sequence in the targetDNA molecule, and
- ii) an activator-RNA that is capable of hybridizing with the targeter-RNA to form adouble-stranded RNA duplex of a protein-binding segment,
wherein the activator-RNA and the targeter-RNA are covalently linked to one another with intervening nucleotides; and
wherein the single molecule DNA-targeting RNA is capable of forming a complex with the Cas9 protein, thereby targeting the Cas9 protein to the target DNA molecule,whereby said system is capable of cleaving or editing the target DNA molecule or modulatingtranscription of at least one gene encoded by the target DNA molecule.
Broad patnet (8,697,359)
Claim 18:
An engineered, programmable, non-naturally occurring Type II CRISPR-Cas system comprising
a Cas9 protein and
at least one guide RNA that targets and hybridizes to a target sequence of a DNA molecule in a eukaryotic cell,
wherein the DNA molecule encodes and the eukaryotic cell expresses at least one gene product and the Cas9 protein cleaves the DNA molecules, whereby expression of the at least one gene product is altered; and,
wherein the Cas9 protein and the guide RNA do not naturally occur together,
wherein the guide RNAs comprise a guide sequence fused to a tracr sequence.
そして、カウントの対象となる各出願／特許のクレームは下記の通りです。要は、ほぼ全部ですね。
UCB出願
15/947,680：Claims 156-185
15/947,700：Claims 156-185
15/947,718：Claims 156-185
15/981,807：Claims 156-185
15/981,808：Claims 156-170, 172-185
15/981,809：Claims 156-170, 172-185
16/136,159：Claims 156-184
16/136,165：Claims 156-184
16/136,168：Claims 156-184
16/136,175：Claims 156-184
Broad特許
8,697,359：Claims 1-20
8,771,945：Claims 1-29
8,795,965：Claims 1-30
8,865,406：Claims 1-30
8,871,445：Claims 1-30
8,889,356：Claims 1-30
8,895,308：Claims 1-30
8,906,616：Claims 1-30
8,932,814：Claims 1-30
8,945,839：Claims 1-28
8,993,233：Claims 1-43
8,999,641：Claims 1-28
9,840,713：Claims 1-41
14/704,551：Claims 2, 4-18
前回は、抵触判断ではじかれ、先発明の判断まで至りませんでしたが、今回のクレームはかなり近しいクレームとなっているため、先発明の判断も行われる可能性が高そうです。
さてさてどうなるやら。
J-PlatPatのRSS機能を用いた経過監視の仕方
６月６日にJ-PlatPatでRSS機能がリリースされたと公表されました。
J-PlatPatでは対象案件について更新があると、翌日にJ-PlatPatでの情報が翌日に更新されるため、RSS機能を用いると更新された情報を随時確認することで経過監視が可能になります。
なお、J-PlatPatにも記載がありますが、RSS機能の対象となる書類は2019年6月5日以降となりますので、それ以前の書類については対象外です。
対象案件についてRSSリーダーへの追加方法は下記の通りになります。
1．J-PlatPatで対象案件を探します。願番等での指定、キーワードサーチ等での絞り込みもOK。
2．つぎに、RSSを取得する出願の固定URLのリンクに飛びます。固定URLは矢印で示す「URL」ボタンをクリックすると表示され、表示されたURLをクリックすると該当するWebページに飛べます。新たにできたタブには、「文献固定アドレス用結果一覧」と表示されるかと思います。
3．固定アドレスに飛ぶと、「特許・実用新案紹介（固定アドレス）」の右側にRSSのアイコンが表示されるので、それをクリックします。
（なお、更新情報があれば、直近の更新情報が書誌情報の下に表示されます。）
4．xmlのWebページに飛びますので、このWebページをRSSリーダに追加すれば、更新情報を随時取得できます。
5．RSSリーダに追加すると下記のように、更新情報が表示されますので、対象案件にどのような動きがあったかを随時確認できます。
ということで、今までは有料のデータベースで経過監視を管理をしていましたが、J-PlatPatでも更新情報が簡単に取得できるようになるため、プログラムを組めば、無料で誰でも大量の案件の経過監視をできるようになりそうです。
みんなが大量の案件の経過監視をJ-PlatPatでやるようになると、J-PlatPatのサーバが落ちそうな気もしますが…。
なお、RSS機能は外国語にも対応しているので、外国のクライアントにも教えてあげると喜ばれるかもしれません。
欧州における動植物関連出願の審査・審理停止
2017年に改正されたRule 28(2) EPCについては、以前アップしたように、Article 53(b)の解釈に関するブロッコリ事件・トマト事件における拡大審判部の判断と抵触するとの判断が審判部から示されました。
欧州特許条約上、規則が法令に抵触すると法令が優先されるため（Article 164(2)）、規則は実質無効化されます。
また、一般的な育種方法、いわゆる、交雑・選抜を繰り返す方法で生み出される動植物の特許出願の審査及び審理においては、Article 53(b)+Rule28 (2)がかなり大きな問題となっているため、規則が無効化されたことで、審査・審理が止まるであろうと想定されていました。
そして、ついにEPOから正式に審査・審理の停止がアナウンスされました。
審査・審理の停止は、EPOの長官から拡大審判部に対して、Article 164(2)に基づいて、Rule28 (2)がArticle 53(b)と整合性がとれているかとの質問に対して，拡大審判部の回答が得られるまででであるため、おおよそ2-3年は続くことになると想定されます。
EPOの審査は遅いので、今、EPOにpendingしている案件については、下手をすると、審査・審理のけりが付く頃には特許権の存続期間はほとんど残ってないかもしれませんね…笑
なお、サーチに関しては引き続き行われますので、拡張SRは通常どおり発行される考えられます。
また、クレームがGMの動植物に関することが明確である場合、そもそもArticle 53(b)+Rule28 (2)の規定とは関係ないため（審査ガイドライン G-II 5.4 Plant and animal varieties, essentially biological processes for the production of plants or animals、特に、5.4.2.1参照）、審査・審理は停止しないことになります。
JP Patent status and claim 1 of Broad's CRISPR-Cas9 Patents.
Broadの日本特許３件
特許第6203879号
【請求項１】
クラスター化等間隔短鎖回分リピート（ＣＲＩＳＰＲ）－ＣＲＩＳＰＲ関連（Ｃａｓ）（ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ）ベクター系であって、
Ｉ． ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ系キメラＲＮＡ（ｃｈｉＲＮＡ）ポリヌクレオチド配列をコードするヌクレオチド配列に作動可能に結合している第１の調節エレメントであって、
前記ポリヌクレオチド配列が、
（ａ）真核細胞中の標的配列にハイブリダイズする、１０～３０ヌクレオチドの長さを有するガイド配列、
（ｂ）トランス活性化ＣＲＩＳＰＲ ＲＮＡ（ｔｒａｃｒ）メイト配列、及び
（ｃ）ｔｒａｃｒＲＮＡ配列
を含み、
（ａ）、（ｂ）及び（ｃ）が、５’から３’配向で配置されており、
前記ｔｒａｃｒＲＮＡ配列が、５０以上のヌクレオチドの長さを有する、
第１の調節エレメントと、
ＩＩ． 真核細胞の核中の検出可能な量のＩＩ型Ｃａｓ９タンパク質の蓄積をドライブするために十分な強度の、１つ以上の核局在化配列を含む前記Ｃａｓ９タンパク質をコードするヌクレオチド配列に作動可能に結合している第２の調節エレメントと
を含む１つ以上のベクターを含み；
成分Ｉ及びＩＩは、前記系の同じ又は異なるベクター上に位置し；
前記ヌクレオチド配列が転写されると：
前記ｃｈｉＲＮＡは、前記ＩＩ型Ｃａｓ９タンパク質へと集合し、前記ＩＩ型Ｃａｓ９タンパク質と複合体を形成し、
前記ｔｒａｃｒメイト配列は、前記ｔｒａｃｒＲＮＡ配列にハイブリダイズし、
前記ガイド配列は、前記真核細胞中の前記標的配列への配列特異的結合を指向し、
それによって、（１）前記真核細胞中の前記標的配列にハイブリダイズされる前記ガイド配列、及び（２）前記ｔｒａｃｒＲＮＡ配列にハイブリダイズされる前記ｔｒａｃｒメイト配列と複合体形成している前記ＩＩ型Ｃａｓ９タンパク質を含むＣＲＩＳＰＲ複合体が形成される、
ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓベクター系。
・II型CRISPR-Cas9
・ハイブリダイズの長さ限定
・tracrRNAの長さ限定
特許第6420273号
【請求項１】 エンジニアリングされた、天然に存在しないクラスター化等間隔短鎖回分リピート（ＣＲＩＳＰＲ）－ＣＲＩＳＰＲ関連（Ｃａｓ）（ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ）ベクター系であって、 ａ）ガイド配列、ｔｒａｃｒＲＮＡ及びｔｒａｃｒメイト配列を含む１つ以上のＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ系ポリヌクレオチド配列をコードする１つ以上のヌクレオチド配列に作動可能に結合している第１の調節エレメントであって、前記ガイド配列は、真核細胞中のポリヌクレオチド遺伝子座中の１つ以上の標的配列にハイブリダイズする、第１の調節エレメント、 ｂ）ＩＩ型Ｃａｓ９タンパク質をコードするヌクレオチド配列に作動可能に結合している第２の調節エレメント を含む１つ以上のベクターを含み、 成分（ａ）及び（ｂ）は、前記系の同じ又は異なるベクター上に位置し、 前記ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ系は、前記Ｃａｓ９タンパク質をコードする前記ヌクレオチド配列とともに発現される２つ以上の核局在化シグナル（ＮＬＳ）を含み、少なくとも１つのＮＬＳが、前記Ｃａｓ９タンパク質のアミノ末端に若しくはその付近に存在し、及び、少なくとも１つのＮＬＳが、前記Ｃａｓ９タンパク質のカルボキシ末端に若しくはその付近に存在し、 それによって、前記１つ以上のガイド配列が、真核細胞中の前記１つ以上のポリヌクレオチド遺伝子座を標的とし、前記Ｃａｓ９タンパク質が、前記１つ以上のポリヌクレオチド遺伝子座を開裂し、それによって、前記１つ以上のポリヌクレオチド遺伝子座の配列が、改変される、 ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓベクター系。
・II型CRISPR-Cas9
・NLSが２つ以上
・N末端、C末端にNLS一個ずつ配置
特許第6395765号
ＣＲＩＳＰＲ複合体成分を含む組成物であって、
前記ＣＲＩＳＰＲ複合体成分が、
Ｉ． ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ系ポリヌクレオチド配列（複数の場合も有り）であって、
（ａ）ＲＮＡを含み、ポリヌクレオチド遺伝子座中の標的配列にハイブリダイズし得る、エンジニアリングされたガイド配列、
（ｂ）ＲＮＡを含むｔｒａｃｒメイト配列、及び
（ｃ）ＲＮＡを含むｔｒａｃｒＲＮＡ配列
を含み、
（ａ）、（ｂ）及び（ｃ）が、５’～３’配向で配置されている、
ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ系ポリヌクレオチド配列、
ＩＩ． ＩＩ型Ｃａｓ９タンパク質
を含み、
前記ｔｒａｃｒメイト配列が、前記ｔｒａｃｒＲＮＡ配列にハイブリダイズし、前記ガイド配列が、標的配列へのＣＲＩＳＰＲ複合体の配列特異的結合を指向し、
前記ＣＲＩＳＰＲ複合体が、前記ＩＩ型Ｃａｓ９タンパク質であって、（１）前記標的配列にハイブリダイズされる前記ガイド配列及び（２）前記ｔｒａｃｒＲＮＡ配列にハイブリダイズされる前記ｔｒａｃｒメイト配列と複合体形成している、前記ＩＩ型Ｃａｓ９タンパク質を含み、
前記ＩＩ型Ｃａｓ９タンパク質が、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）Ｃａｓ９（ＳａＣａｓ９）である又はこれを含む、
・小型Cas9（SaCas9）
EP Patent status and claim 1 of UC Berkeley‘s CRISPR-Cas9 Patents.
執筆用メモ
UCBの欧州特許
一本鎖型については本命、欧州では二本鎖型を狙った出願を既に権利化済。
EP2800811B：口頭審理未定（補正クレーム提出済（2018/10/25））
・一本鎖型の基本特許
EP3241902B：異議申立あり
